El Instituto Costarricense de Investigación y Enseñanza en Nutrición y Salud (Inciensa) y la Universidad de Costa Rica (UCR) presentaron los resultados del análisis del genoma del virus SARS-CoV-2, causante de la covid-19 a 70 personas (52 hechos por Inciensa y 18 por UCR).

¿Cómo es exactamente el nuevo coronavirus que circula en Costa Rica? ¿Su estructura genética se parece más a la vista en qué lugar del mundo? Esas son las preguntas que se busca responder con el análisis genómico.

¿En qué consiste? Pensémoslo como conocerlo íntimamente a fondo, gen por gen. Para ello se secuencia y analiza todo su genoma (la totalidad del material genético).

¿Por qué se hace? Es una forma de “conocer al enemigo”. Si se sabe cuáles son los linajes (o familias, o grupos similares) del virus esto puede ayudar a la toma de decisiones en salud pública.

Antes de ver lo que nos dicen es necesario tomar en cuenta dos salvedades. La primera es que este análisis tomó en cuenta al virus de 70 personas de las diferentes provincias de nuestro país, lo que representa al 0,09% de los casos reportados hasta el momento.

Además, esto se hizo en dos épocas muy puntuales: en las semanas epidemiológicas de la 10 la 17 (entre principios de marzo y finales de abril) y luego entre las semanas 23 y 27 (en el mes de julio) y no representan posibles características de un virus que circule en este momento.

Por ello, esto no puede tomarse como resultados concluyentes, pero sí nos indican cosas importantes. Por un lado, que Costa Rica cuenta con el talento y la capacidad de realizar paso a paso este análisis desde cero. Por otro, estos datos sirven de punto de partida para un análisis más riguroso con los virus que se están secuenciando en este momento.

Además, ya se cuenta con más datos de los que se tenían el 30 abril, cuando se anunciaron los primeros análisis genómicos del virus que infectó a seis personas.

También hay datos de otros países que nos ayudan a poner las cosas en perspectiva. Francisco Duarte, coordinador del Laboratorio de Genómica del Inciensa, dijo a La Nación que en otros países con más población, más casos y más recursos solo manejan también han realizado análisis genómicos de una fracción muy pequeña de las muestras, dado que se requiere no solo de un alto nivel de especialización, si no que los reactivos son costosos.

“En Argentina se han hecho 400 genomas (este viernes se anunciaron 765.002 casos acumuados, unas diez veces las de Costa Rica), en Colombia 128 (841.531 casos acumulados) y en Perú 230 (818.297 confirmados)”, expresó el científico.

Siete linajes, tres prioritarios

Los análisis indican que, para las muestras estudiadas, se encontraron siete linajes o familias del virus.

De ellas hay tres prioritarias, que son denominadas B1 (con el 49% de las muestras estudiadas), B1.5 (con el 21%) y B1.1 (con el 19%). Según explicó Duarte, este B1.1 es el que comenzó a verse después, y resultó más presente en lo estudiado en julio.

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El científico añadió que las mutaciones (cambios del virus en su genética) mostradas hasta el momento son muy pocas; solo se ven de 6 a 11. También se analizaron los virus presentes en personas que fallecieron, pero no se encontraron diferencias.

“Son mutaciones muy similares a las vistas en el resto del mundo. Ninguna está relacionada con una mayor agresividad del virus”, manifestó Duarte.

La mutación más presente es la llamada d614g. Duarte confirmó que ninguna de las mutaciones vistas en suelo nacional hasta el momento están relacionadas con zonas que pudieran cambiar la eficacia de las pruebas de detección por PCR (que buscan si hay porciones del ARN del virus, lugar donde este guarda su información genética).

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